Con el fin de asegurar que ninguna de las conductas señaladas en el Protocolo se toleren, así como la necesaria atención a las personas -en especial a las mujeres- que han sido objeto de las mismas, el pasado 23 de diciembre de 2020 se creó la Unidad de Atención de Quejas por Posibles Conductas contra de la Dignidad de las personas, Discriminación del alumnado y Violencia hacia las Mujeres. A partir del 1 de enero de 2021, la Unidad se encarga de dar atención y seguimiento a las quejas presentadas según lo establecido en el presente Protocolo y emitir las recomendaciones correspondientes. Con apoyo en dichas recomendaciones, la Junta Directiva emite reglas de conducta de cumplimiento obligatorio para toda la comunidad de la Escuela Libre de Derecho. Actualmente la titular de dicha Unidad es la Doctora Guadalupe Magdalena Sánchez Palacios.
Esta Unidad retomó la labor iniciada por la Defensoría de Derechos de la Comunidad Escolar de la Escuela Libre de Derecho.